Ekolojik sistemlerde canlıların yaşam alanları ve etkileşimleri karmaşık bir ağ oluşturur.
Habitat ve Ekolojik Niş, canlıların yaşam alanlarını ve rollerini tanımlayan temel kavramlardır. Habitat, bir organizmanın yaşadığı fiziksel ortamı ifade ederken, Ekolojik Niş o canlının ekosistem içindeki işlevsel rolünü ve etkileşimlerini kapsar. Ekolojik Niş Örnekleri arasında kuşların farklı yüksekliklerdeki ağaç dallarını kullanması veya deniz canlılarının farklı derinliklerde yaşaması sayılabilir. Komünite içinde yaşayan canlılar arasında çeşitli etkileşimler görülür. Mutualizm, arı ve çiçek arasındaki karşılıklı fayda ilişkisi gibi her iki türün de yarar sağladığı bir etkileşimdir. Amensalizm ise bir türün zarar görürken diğerinin etkilenmediği ilişki türüdür.
Popülasyon Ekolojisi, belirli bir alanda yaşayan aynı türe ait bireylerin oluşturduğu toplulukları inceler. Popülasyon yoğunluğu ve dağılımı, türlerin yaşam başarısını etkileyen önemli faktörlerdir. Düzenli dağılım, kümeli dağılım ve rastgele dağılım olmak üzere üç temel popülasyon dağılım çeşitleri vardır. Ekolojik taşıma kapasitesi, bir habitatın destekleyebileceği maksimum popülasyon büyüklüğünü belirtir. Birincil ve ikincil süksesyon ise ekosistemlerin zaman içinde değişim ve gelişim süreçlerini açıklar. Bu süreçler, tür içi ve türler arası rekabet ile şekillenir ve ekosistemin dinamik yapısını oluşturur.